Alt beyin biyolojik olarak fiziki yapıda korteksin altında, beyinciğe kadar olan büyük gri bölümü oluşturuyor. İki lob olarak korteksin (beyin zarı/zihin) sıkı sıkıya sarıp sarmaladığı en geniş kapsadığı alan.
 
Genel olarak alt beyin/şuuraltını günlük düşünce ve işlerimizi yönetmek için kullanamıyoruz. Daha çok alt beynimiz vücudumuzda sinir sistemi sayesinde iletilen kimyasal, elektriksel, barındırdığı genetik kodlarla birlikte gelen sezgisel bilgileri korteksin talimatlarıyla işlemek için kullanılıyor.

Öncelikle alt beyin sistemi kayda alınmış duygularımızın ve içgüdülerimizin en önemli kaynağıdır. Diğer bir özelliği atalarımızdan RNA (Rubo-Nucleic Asid) denilen molekül yardımıyla bilgi şifrelerini taşır, işler, çoğaltır ve depolar. En önemli fonksiyonu da; otonom sinir sistemi kanalı ile nöro-hormono-transmitter bir mekanizmayla iç organlarımızı refleksif olarak mükemmel komuta ederek müdahale etmeksizin tüm biyolojik sistemimiz kendiliğinden işlevlerini yerine getirir.

Alt beynimiz yaşamımız boyunca her ne olursa olsun uyku, şok, hafıza kaybı vs.gibi birçok durumlarda da işlediği ve geliştirdiği bilgilerini kullanır ve hiçbir şekilde durmaz.